Profesyonel kariyerine altyapısından yetiştiği Avusturya ekibi Admira Wacker'de başlayan Janko, buradaki başarılı 3 sezonun ardından Red Bull Salzburg'a transfer oldu. Salzburg'da kariyerinin zirve sezonlarını yaşayan ve gol rekorları kıran Avusturyalı forvet, 2010 yılında ilk kez ülkesinden ayrıldı ve Twente'nin kadrosuna katıldı.

Hollanda'daki 2 yılın ardından yarım sezonluk Porto macerası yaşayan Janko'nun bir sonraki durağı ise Türkiye oldu. Trabzonspor'da beklenen performansa bir türlü ulaşamayan Avusturyalı golcü kariyerinin kalan döneminde sırasıyla Sydney FC, Basel, Sparta Prag ve Lugano formaları da giydikten sonra 2019 yazında futbolu bıraktı.

Kariyerini noktaladıktan sonra sporun içinde kalmaya devam eden ancak sektör değiştiren Janko, şu anda Sky Sport Austria'da futbol analizi yapıyor.