1994 yılında futbola ülkesi ekiplerinden Danubio FC'de başlayan Recoba, Uruguay'da Nacional'de de oynadıktan sonra Inter'e imza attı ve İtalya'nın yolunu tuttu. Serie A'da farklı dönemlerde kiralık olarak AC Venezia ve Torino formaları giyen Uruguaylı oyuncu, yaklaşık 9 sezon başarıyla Inter'de oynadı. 

2008'de 11 yıllık Çizme macerasının ardından Panionios'a imza atan ve Yunan Ligi'nde boy gösteren Recoba, 2010 kış transfer döneminde ise futbola başladığı Danubio'nun kadrosuna katılarak ülkesine geri döndü. Uruguaylı yıldız kariyerinin son yıllarını ise yıldızının ilk parladığı Nacional'de geçirdi.

46 yaşındaki Uruguaylı eski futbolcu şu anda 2015 yılında futbol kariyerini sonlandırdığı Club Nacional'in B takımını çalıştırıyor.