2004 yılında profesyonel kariyerine Independiente Medellin formasıyla başlayan Juan Pablo Pino, gösterdiği performansla Monaco'nun dikkatini çekti ve 2007 kış transfer döneminde Fransız ekibinin kadrosuna katıldı. 3 yıl Fransa'da forma giyen Pino, 2010 yazında Galatasaray'a imza atarak Süper Lig'e adım attı. Sarı kırmızılılarda bir türlü istenen performansı veremeyen Pino, Galatasaray macerası sonrası da dikiş tutturamadı ve günümüze kadar birçok farklı kulüpte forma giydi.

Şu anda 34 yaşında olan kanat forvet, son olarak 1 Ocak 2021'de imza attığı Kolomiya B Ligi ekiplerinden Real Cartagena'da forma giyiyor.