Futbola ülkesinin Hajduk Split takımında başlayan Milan Rapaic, ilk yurtdışı deneyimini İtalya'nın Perugia takımıyla yaşadı.

Buradaki performansıyla Fenerbahçe'nin dikkatini çeken yıldız futbolcu, 2000 yılında sarı-lacivertli kulübe imza attı.

Fenerbahçe formasını 2.5 yıl terleten Rapaic, ilk yılında, 2000-2001 sezonunda şampiyonluk sevinci yaşadı.

Fenerbahçe'de toplam 67 maça çıkan Rapaic, 16 gol ve 20 asist katkısı verirken, 2003 yılının Ocak ayında kulüpten ayrıldı.

İkinci Hajduk, Ancona, Standard Liege ve Trogir serüvenlerinin ardından Hırvat futbolcu, 2009 yılında futbol kariyerini noktaladı.

Milan Rapaic, şu sıralar futbolcu menajerliği yapıyor.