Porto'nun alt yaş kategorilerinde forma giydikten sonra profesyonel kariyerine de aynı kulüpte başlayan Bruno Alves, ülkesinde Farense ve Vitoria Guimaraes ile Yunanistan'ın AEK ekibinde kiralık olarak forma giydi. Sonraki dönemde Porto'nun vazgeçilmez isimlerinden biri haline gelen Alves, uzun yıllar Portekiz'in köklü ekibinin formasını başarıyla terletti. 

2010 yazında Zenit'e imza atarak yüksek bir bonservis bedeliyle Rusya'nın yolunu tutan Portekizli savunmacının bir sonraki durağı ise Türkiye oldu. 2013'te Fenerbahçe ile sözleşme imzalayan Alves, 3 sezon boyunca sarı lacivertlilerde başarılı bir performansa imza attı. Türkiye'den ayrıldıktan sonra ilerleyen yaşına rağmen istikrarını koruyan Alves; sırasıyla Cagliari, Glasgow Rangers, Parma ve Famalicao'da oynadı. 

39 yaşını doldurmak üzere olan Portekizli başarılı savunmacı şu anda, eylül ayı başında kadrosuna katıldığı Yunanistan 1. Lig'i ekiplerinden Apollon Smyrnis'in başarısı için ter döküyor.