Futbola, ülkesinin Boca Juniors takımında başlayan Riquelme, 5 yıllık serüvenin ardından 2002 yılında Barcelona'ya transfer oldu.

Katalan ekibinin formasını 2 sezon terleten Riquelme, La Liga'nın bir başka önemli ekibi Villarreal'e transferiyle, "sarı denizaltılar" için 45 gol atacağı, unutulmaz bir deneyime başladı.

Çocukluğundan gelen Boca Juniors sevgisini her fırsatta dile getiren yıldız futbolcu, 2008 yılında yeniden gönül verdiği kulübe döndü. 

Daha önce iki kez Libertadores Kupası şampiyonluğu yaşadığı Boca ile bu zafere bir kez daha ulaşan, bir de Sudamericana Kupası kaldıran Riquelme, kısa dönem de Argentinos Juniors'da boy gösterdikten sonra 2015 yılında emekli oldu.

42 yaşındaki Riquelme, şu sıralar yine Boca Juniors'da "as başkan" olarak görev yapıyor.